A ACIJS conta com 17 Núcleos Empresariais, que envolvem 220 empresas. A intenção é desenvolver ações conjuntas e fortalecer os setores envolvidos com a organização de projetos no meio empresarial. Os Núcleos representam os seguintes segmentos:
Além dos segmentos específicos, o programa conta com um Conselho de Núcleos que integra todos os líderes de Núcleos Empresariais.